Endemik bir bitki olan göl soğanı üzerine araştırmalar yapan bir bilim kadını olan Denise, mutsuz bir evliliğin ardından Türkiye’nin Karadeniz kıyısındaki Karacaköy’e yerleşmiştir. Kendisinden yaşça küçük olan insan kaçakçılığı yapan Hamit adında bir sevgilisi vardır. Denise geçmişini, Hamit ise gerçek mesleğini gizlemekte, her ikisi de birbirlerinden sırlar saklamaktadır. Hamit daha önce defalarca yaptığı gibi bir grup mülteciyi deniz yoluyla Avrupa’ya yasadışı olarak geçmesini organize etmektedir. Denise’in bu mülteci grubundan Sonya adlı küçük bir kız ile karşılaşmasıyla gerilim yükselmeye başlar. Yaklaşmakta olan bir fırtına hissi filme hakim olur.

Üç günde geçen film üç bölümden oluşuyor: Kıyı, Küller ve Su. Bu bölümler kronolojik olmayan bir şekilde düzenlenmiştir ve kesişme anları üzerinden olayların farklı yönlerine odaklanır. Her bölüm, belli bir karakterin gözünden olayların farklı bir yönünü anlatır.